生物药物 - HLA-DR多肽结合口袋的静电势变化同PSC疾病关系研究

时间:2014-04-04

 

多肽表面的静电势研究 - HLA-DR多肽结合口袋的静电势变化同PSC疾病关系研究
 
背景:原发性硬化性胆管炎(primary sclerosing cholangitis,PSC)是一种慢性肝胆疾患,病情呈进行性发展,最终导致胆管阻塞、胆汁性肝硬化和肝衰竭。目前病因不明,但PSC在家族成员中集中发病现象与人体白细胞抗原(HLA)密切相关的事实提示遗传因素在PSC发病中的重要作用。
 
思路:本文的目的即研究HLA-DR中的多肽结合凹槽与PSC之间的关系。首先,研究人员找到356名PSC患者用以研究致病基因,用366名健康人员做对照,通过R统计方法找出37位和86位残基在PSC患者中最为突出,且37位为致病基因,86位可以起到保护作用。为了研究具体作用机制,作者对HLA-DR用MODELER进行同源建模,得到蛋白三维结构后,又利用DS_DelPhi,计算模型表面静电势。
 
图1. 上面的三维模型分别为DRB1*13.01和DRB1*13.02,下面的分别为两结构的表面静电势分布,
Pocket9中37位残基都为Asn,但却由于Pocket1中的86位残基由Val变为Gly,使得Pocket9的静电性从正电到负电。
 
Ref: Johannes R. Hov,* VasilisKosmoliaptsis,* James A. Traherne, et al. HEPATOLOGY. 2011, 53.