计算生物学 - 糖基化对于线粒体复合物I活性的影响

时间:2014-04-04

 

蛋白-蛋白相互作用研究 - 糖基化对于线粒体复合物I活性的影响
 
背景:之前的研究表明,线粒体的氧化应激与颞叶癫痫的发生有重要关系,但是这会对线粒体的功能有什么影响并不清楚。在本文中,作者通过实验确定了,当氧化应激发生时,线粒体中的Complex I (CI)的Arg76会发生糖基化,从而导致CI催化能力的下降。
 
思路:作者进一步通过计算机模拟的技术,构建了糖基化之前和之后的CI亚基结构,基于ZDOCK预测了CI亚基与其他亚基之间的相互作用能力,明确的观察到了Arg76糖基化对于CI亚基的催化中心结构,以及与其他亚基结合能力的影响。计算的结果与实验结果一致,并且很好的解释了糖基化影响CI功能的机理。
 
图1. B:T. thermophilus(PDB ID:3IAM)的CI亚基的晶体结构,C:基于3IAM为模板同源建模的小鼠CI亚基结构。
D:同源建模的结构细节图。E:原始与修饰的蛋白相互作用能对比。
 
Ref: K. Ryan, D. S. Backos, P. Reigan, et al. J Neurosci. 2012, 32(33):11250-11258.