药物设计 - 基于Hiphop进行hOCTN2抑制剂的虚拟筛选

时间:2014-04-04

 

药效团模型 - 基于Hiphop进行hOCTN2抑制剂的虚拟筛选
 
背景:DS Catalyst Hypothesis的HipHop算法是基于活性化合物的公共特性产生药效团模型的一种方法,可用于大规模的虚拟筛选。hOCTN2(人肉毒碱/有机阳离子转运体)调控L-肉碱的体内平衡,L-肉碱参与中间代谢过程,控制长链脂肪酸进入线粒体,使其氧化提供能量。hOCTN2底物抑制剂可能与横纹肌溶解有关。
 
思路:作者利用药效团模型筛选的方法,对SCUT数据库进行了虚拟筛选。结果作者得到30个符合要求的抑制剂分子,并且其中的16个小分子已经报告与横纹肌溶解有关,从而通过药效团模型的方法,证明了hOCTN2底物抑制剂可能会引起横纹肌溶解的副作用的观点。
 
 
Ref:Sean Ekins, Lei Diao, James E.Polli.Mol Pharm. 2012 April 2; 9(4): 905–913.