药物设计 - 基于血管表皮生长因子受体激酶(VEGFR-2)构建药效团模型并结合分子对接进行虚拟筛选

时间:2014-04-04

 

基于蛋白结构的药效团模型与分子对接联用

基于血管表皮生长因子受体激酶(VEGFR-2)构建药效团模型并结合分子对接进行虚拟筛选

 

背景:表皮生长因子受体的过度活化与肿瘤生长和分级(包括增殖、血管发生、浸润和转移)的关键过程有关。目前,以EGFR作为肿瘤靶标的研究比较多。

 

思路:韩国的研究人员采用DS SBP基于此受体构建药效团模型,筛选流程如图1,最后通过DSLigandfit进行分子对接筛选得到100个化合物进行购买和测活,得到了10个活性非常好的活性化合物IC50在2μM左右,这是迄今活性最优的潜在VEGFR抑制剂。

表1.筛选得到的10个活性化合物的LigandFit评分及活性值

图2. 基于VEGFR的药效团模型。图3. 虚拟筛选流程。

 

Ref: Lee K, Jeong KW, Lee Y, Song JY, Kim MS, Lee GS, Kim Y. European Journal of Medicinal Chemistry. 2010, 45:5420-5427.