药物设计 - 基于2D-QSAR识别新型S6K1抑制剂

时间:2014-04-04

 

定量构效关系 - 基于2D-QSAR识别新型S6K1抑制剂

 

背景:QSAR是经典应用广泛的基于配体结构的药物设计方法。S6K1是治疗糖尿病引起肥胖的潜在的一个靶标。

 

思路:本文采用DS GFADS HipHop和分子对接的方法,针对Specs数据库进行虚拟筛选,最终得到215个先导化合物分子。为得到骨架新颖的先导化合物分子,对215个小分子进行聚类,最终得到了60个具有潜在活性的先导化合物分子。为下一步的体外测活实验提供了很好的潜在活性分子骨架,为先导化合物的改造提供理论基础。

图1.GFA模型活性验证及虚拟筛选策略。

Ref:Hui Zhang, Ming-Li Xiang, Jun-Yu Liang, Tao Zeng, et al. Mol Divers. 2013,17:767-772.