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产品名称(英文):NeoSuite CMS

产品名称(中文):化合物信息管理系统

软件厂家:NeoTrident

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产品简介:

创腾科技有限公司基于工业标准的化学结构数据处理技术(ISIS Direct)开发的化合物管理系统NeoSuite CMS(Compound Management System),可以对研发过程中产生的与化合物与其相关信息(如项目信息、结构、反应路线、工艺、谱图、药效、药代和毒理等)进行正确的关联,实现规范和有效的管理。NeoSuite CMS采用分级用户管理可以有效保护企业知识产权,研究人员和主管可以通过NeoSuite CMS系统随时了解项目进展,为研发决策提供重要依据。

  • 产品详情
  • 常见问题
      对于医药、精细化工、农药及石油化工等行业的研发机构在研发过程中所产生的与化合物相关的数据,是研究机构和企业的宝贵财富,同时也是研究机构和企业研究水平和核心竞争力的体现。因此如何对这些数据进行有效的积累和管理,尽早建立规范合理的信息平台,是每个研究机构和企业必须面对的重要课题。如果一个企业或研发机构的化合物信息管理仍停留在传统手工管理的层次上,必然会导致出现一些信息交流、管理方面的瓶颈和阻碍。
 
  •  实验人员的实验记录书写不够规范;
  •  关键的实验信息遗漏;
  •  化合物信息所涉及的实验种类和实验人员众多,数据分散;
  •  历史化合物数据查询十分不方便,难以被参考和重复利用;
  •  实验结果很难通过纸版实验记录进行共享和同步更新;
  •  纸版实验记录本保管费时费力,时间长了很容易损坏;
  •  随着企业的不断壮大,研究项目也不断增多,项目管理人员了解项目进展和实验人员工作状况的难度也逐渐增大。
      ……
      企业需要一个集中智能化的化合物信息管理平台来提取有用的研发信息,为科研人员和研发主管提供便利。由创腾科技有限公司基于工业标准的化学结构数据处理技术(ISIS Direct)开发的化合物管理系统NeoSuite CMS(Compound Management System),可以对研发过程中产生的与化合物与其相关信息(如项目信息、结构、反应路线、工艺、谱图、药效、药代和毒理等)进行正确的关联,实现规范和有效的管理。NeoSuite CMS采用分级用户管理可以有效保护企业知识产权,研究人员和主管可以通过NeoSuite CMS系统随时了解项目进展,为研发决策提供重要依据。

图1. 化合物管理系统NeoSuite CMS
 
系统功能介绍
     本系统主要具有以下六个模块:项目信息(分为项目信息和合作伙伴信息)、化学信息(包括样品信息、反应信息、谱图信息)、生物信息(包括体内体外药效、药代、毒性、ADME)、申领管理、审批管理和系统管理。
 
  •  项目信息
       该模块提供项目信息(如项目状态、项目文档)和合作伙伴信息的记录查询,通过对这些信息的收集整理,项目管理人员能够及时准确获取关键的节点信息。


图2. 项目信息模块

 
  •  ​化学信息
      化学信息模块涵盖了与化合物及不同批次的同一化合物(即样品)相关的重要研发数据,包括化  学信息、样品基本信息、合成路线、测试谱图等。化学研发人员可在该功能中完成一系列化学信息的录入。


图3. NeoSuite CMS中进行化学信息的维护

 
 
      在化合物信息维护中,用户可以利用专业的画图公交Symyx Draw绘制各种形式的化学物质,并自动计算它们的基本属性(分子量、分子式、ALogP和PSA)。该模块的特点是:
 
(1)化合物结构登录后,系统自动检测登录结构是否存在,保证结构唯一性,避免重复;
(2)化合物ID自动编号,英文名称由系统按照国际通用的IUPAC规则自动产生,减少错误和系统数据冗余;;


图4. 在NeoSuite CMS中登录化合物的基本信息

 
 (3)实现了样品的自动编号功能,通过系统管理员可以切换样品编号方式(自动编号或者手动编号),也可以灵活配置企业内部统一的样品编号规则;
 (4)支持化合物信息的SD文件和Excel文件的批量导入,不用逐一处理,节省记录时间;


图5. 在NeoSuite CMS中批量维护化合物信息

 
(5)基于ISIS Direct技术开发的NeoSuite CMS,除了能够注册普通的化合物单体,而且能够识别管理手性异构体和盐类物质(Salts)。

图6. NeoSuite CMS中手性化合物的注册
 
(6)化合物与项目信息关联,项目主管可由此统计项目相关的化合物数目,实时跟踪项目进度;

图7. NeoSuite CMS中查看项目下的化合物信息
 
(7)在该模块中,除了支持化合物信息的录入,用户可以在权限允许的范围内通过多种检索方式得到需要的结果。检索方法上,用户可以利用精确查询与模糊查询。除了通用的数值和文本等检索字段外,还可以用化合物精确结构、子结构、相似结构、反应式和反应细节等进行检索。

图8. NeoSuite CMS中进行检索
 
(8)用户可根据提示查看检索结果,系统可选择性地自定义查询结果中某些属性显示或者隐藏,并可对每一列进行降序或升序排列查看。用户可以将关心的内容输出SD文件或Excel文件,以便在其他系统中读取和部门之间共享。。


图9. 在NeoSuite CMS中自定义导出查询结果

 
  •  生物信息

      基于生物信息维护功能,生测研发人员可以完成不同模型(体内、体外)和不同组织水平(如细胞水平、酶、分子水平和组织水平)等多种类型的生物测试实验数据的录入和维护。该功能的特点是:使用简单,灵活性强,常用输入项下拉框式设计进一步加强用户数据的录入效率和系统便捷性.


图10. NeoSuite CMS中录入各种类型的生测信息

 
      在生物信息查询中,汇集了生物模型中常用的检索字段如动物模型、表征指数、筛选指标等作为关键字,供使用者做各种组合性检索,提供方便、快捷的查询途径。用户点击相应的链接即可直接进入样品的详细生测信息页面进行浏览。

图11. NeoSuite CMS中查询生测信息
 
  •  申领管理
      整合化合物库存管理系统后,用户可以在Neosuite CMS界面中查看样品的库存情况,有权限的用户还可以直接在CMS中提交样品申领请求。


图12. NeoSuite CMS中申领样品

 
  •  审批管理
      NeoSuite CMS支持数据审批和录入自动查错,以确保录入信息的准确度,提高企业的信息管理能力。
    
图13. NeoSuite CMS中进行审批处理
 
  •  系统管理
      由于各个企业的化合物信息管理分别存在不同程度的个性化需求,因此,NeoSuite CMS系统在开发过程中充分考虑了这一因素。在系统中,客户可根据实际情况进行灵活配置,实现项目的差异化管理,如系统允许用户配置自身特色的化合物和样品的编号规则。NeoSuite CMS系统可供客制化的功能还包括自定义界面字段、自定义字典、用户权限和审核流程。                           

图14. NeoSuite CMS中灵活配置的模块
 
      为了保护企业的知识产权,系统特别设置了权限分组的功能。在高级管理员用户的许可下,系统允许根据项目添加组员。只有授权的组员才能看到项目相关的化合物。对于同一个化合物不同类型的数据,每个用户只能看到授权的化合物信息(如生物部门只能看到生物信息,不能查看化合物的结构)。

图15. NeoSuite CMS中根据项目需要分配权限
 
 
应用价值
 
  •  确保化合物信息管理的规范化和完整性
      医药研发仿佛是一个大型信息工厂,在研发过程中所产生的科研数据是研究机构及企业进行新产品和新工艺研究和开发最重要的基础数据。记录这些数据的最基本要求是真实、及时、准确和完整。但在实际研发过程中,经常有实验记录不够完善、新的数据没有及时更新等现象的发生。NeoSuite CMS可设置某些条目强制输入,确保必要的实验内容是完整的,没有遗漏和丢失。对于必须符合特定格式的输入,系统能自动检测是否符合标准并给出必要提示。
 

图16. NeoSuite CMS中利用强制输入来规范信息的记录
 
  •  支持项目管理,有利于项目管理人员及时了解项目进展
 
      在实际工作中,项目规模往往比较大,持续时间较长。NeoSuite CMS将项目名称、项目负责人等信息收集整理进来,并与化合物进行关联。化合物的登录情况反映出项目的进度和实验人员的科研工作,管理人员据此能够及时把握项目进度,保证项目顺利进行。
 
  •  集中存储和深入挖掘科研数据,为决策提供更有力的支持

      制药化工企业的化合物数量和实验类型的复杂程度在不断地变化,NeoSuite CMS可将研发过程中化合物和其他不同的元素加以关联整合,可提供用户包括项目信息、化合物理化性质、生测信息等较为全面的科研数据。科学家们在全面了解信息的情况下做出及时的决策。除此之外,NeoSuite CMS还可以为用户进一步分析和数据挖掘提供方便。整合Pipleline Pilot和Isentris数据挖掘软件后能对数据进行可视化分析,帮助企业构建高效信息化系统平台来管理和分析科研数据。     

 

    

 图17. 利用Pipleline Pilot和Isentris进行数据挖掘
 
 
  •  实现研发工作流程的信息化,提高研发效率
 
      研发工作流程中的最重要的环节是快速地从大范围的资源中查询化学信息。NeoSuite CMS通过多种检索功能(见图8和图11),简化了研究数据的获取过程,帮助用户在更短的时间内查到有用的信息,可以节约大量的研发时间。
 
  •  实现信息共享
      本系统实现了对相对复杂的分子结构和反应等相关科研数据的系统管理,可以通过Browser/Server模式在机构内部或是合作单位之间实现信息共享。研究机构及企业通过NeoSuite CMS有效的化合物信息管理,使其可以为整个机构所利用,进而提高企业组织的竞争力。
 
 
主要特点
化合物管理系统NeoSuite CMS具有如下的特点:
(1)支持全中文的界面和环境,客户端基于浏览器界面,便于操作和使用;
(2)系统支持和确保数据库中化学结构的唯一性,并自动对化合物进行唯一编号;
(3)支持手性化合物和盐类的信息登录
(4)支持SD格式的批量化合物的导入导出,并支持各种通用的化学绘图工具;
(5)支持子结构检索、精确结构检索、组合检索等各种检索功能;
(6)可集中管理化合物的相关物化性质、多步合成路线及实验数据、多个分析图谱和生物测试数据,并可对各类字段进行在线的灵活配置,而不需要额外的编程工作;
(7)系统实现了样品申领和数据审批流程
(8)系统具有严格的安全机制,可针对客户需求对安全机制进行严格和灵活的配置,确保所有数据在安全可靠的基础上发挥最有效的应用,保护知识产权;
(9)可与其他软件或管理系统进行整合,形成企业级整体信息解决方案;
(10)创腾科技强力的技术支持,丰富的管理系统开发经验,实施周期短。
                

 

► 问:对于CMS记录进去的生物活性信息能否按照活性数量级的大小自动排序筛选?

     答:可以进行排序筛选,特别是4.0增加了数据综合分析视图,加强了此功能


► 问:NeoSuite CMS 4.0 化合物注册管理系统主要服务的对象有哪些?

     答:NeoSuite CMS 4.0 化合物注册管理系统以化合物结构为基本信息,把归纳和梳理后的项目信息,样品信息,反应路径信息,谱图信息,生测信息进行集中存储和管理,为精细化学及新药研发实验室提供规范的化合物信息管理手段。因此其主要服务对象有:

1) 创新药研发实验室
2) 有机合成实验室
3) 农药研发实验室


► 问:和原来的版本相比,NeoSuite CMS 4.0 化合物注册管理系统最大的更新有哪些?

     答:1)为便于合成部门和生物部门之间的协作,全面增加了测试任务管理功能模块,从测试任务申请,审批,任务分配,测试完成结果录入整 个流程全面线上自动流转,大大提升了实验室效率。
2) 新版本根据用户的使用反馈,优化的用户界面友好度。化合物信息,样品信息,谱图信息以及合成路线信息进行了有效的关联,操作更方便。
3) 系统提供了自定义字段,自定义表单和自定义实验方法功能,具有很好的灵活性和可拓展性,可允许用户根据最新的生物测试来配置合适实验方法,因此可满足不同的生物测试部门使用。


► 问:CMS 化合物注册管理系统和电子实验记录本(ELN)有什么区别?

     答:电子实验记录本(ELN)主要是用于进行实验过程的记录,实现纸质实验记录电子化。因此其记录内容主要为过程数据,而且还会有一些是错误的,或者无效的数据。

NeoSuite CMS 4.0 化合物注册管理系统则是把实验的结果经确认后,把有效的合成的化合物信息进行集中注册和管理,因此其主要管理的是经总结归纳后的化合物信息。可以把ELN作为过程数据管理系统,而CMS作为新药研发实验室的化合物成果管理系统。

目前我们已经完成ELN系统和CMS系统的系统接口,可实现从ELN中将化合物信息一键注册到CMS中。


► 问:在CMS中如何实现对合成的化合物实物样品进行有效管理?
     答:在新药研发实验室,合成的化合物是实验室最宝贵的财富。在CMS中可实现对合成化合物的样品信息进行注册和维护,如果要实现对实物样品的管理,需要和我公司开发的NeoSuite CIMS 4.0 化学试剂库存管理模块配合使用,通过条码化的管理,实现对私有样品的样品入库,查询申领,分装出库,签收等全生命周期管理。通过底层接口,实现注册样品信息时,直接生成入库信息,打印条码贴在样品上,送到库房,库房收到样品后入库上架。研发人员可在线上查找样品信息,并提交申领请求,库房线上查看到申请后进行分装出库,研发人员接收后签收,样品用完后申请报废。从而实现了对实物私有样品进行信息化自动化的管理。


► 问:在CMS中如何保证化合物信息的安全?
     答:在CMS中有严格的审批制度和权限控制机制,每个用户根据自己的权限对数据库进行访问,没有相关权限是禁止访问相关数据的。例如,我们可以实现合成人员不可以看生物测试的数据。而生物测试人员只能看到样品的编号,而无法看到样品的化学结构。而项目负责人则可即能看到项目下的化合物信息,又可以看到对应的生物测试数据。在NeoSuite CMS4.0中,管理员可以方便灵活的对用户进行权限管理,从而降低维护的难度。


► 问:CMS客户有哪些?
     答:目前我们的客户主要有两类,企业的研发中心和科研机构的化学制药类实验室。CMS的成功上线,为这些研发机构集中管理化合物信息提供了有效手段,保护了知识产权。

制药企业研发中心

上海恒瑞制药有限公司

扬子江药业集团有限公司

杭州本生药业有限公司

四川海思科制药有限公司

广东东阳光药业有限公司

浙江海正药业股份有限公司

和记黄埔医药(上海)有限公司
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科研机构的化学制药实验室

北京大学深圳研究生院化学生物学与生物技术学院

中国科学院昆明植物研究所

中国医学科学院药物研究所
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