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  • 我在用DMol3研究物质热力学性质的时候,发现结果中的Cp S与文献值相同,但是H G差太多,请问是什么原因?比如NH3,结果中H=23.844kcal/mol,最后一个Ef行有三个值,-59.324838Ha,-3.4152404Ha,1.6m,那么NH3(g)的值是用哪个值与H相加?
    H和G加了计算得到的单点能吗?outmol给出的H和G是变化值,不是绝对值。第一个,第二个是binding energy。同时注意单位Ha和Kal/mol的换算关系。

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  • 我想实现材料不同浓度空位的计算,比较能带,方法是建立不同大小的超胞然后扣除其中一个原子,但是杂质能级和导价带杂化比较严重,能带和态密度不好描述,请问有解决办法吗?
    因为我们使用DFT程序计算空位或者掺杂的时候,都是重掺杂,会出现您提到的状况。¬态密度试了吗?在分析态密度的参数设置面板上,将宽化参数smearing值调低试试,这样峰宽会变窄,实在不行,就得进一步增加supercell。

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  • 请问计算热力学性质,也就是计算声子谱,得到的吉布斯自由能曲线的能量是整个体系的吗?比如,优化静态能量为-4900ev,算出298k下吉布斯自由能只有-0.5ev?
    这个自由能数据是变化值,不是绝对值。

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  • castep里initial spin 和use formal spin as initial分别是什么意思呢?如果体系单电子数是1,那initial spin就是2吗?
    您好,initial spin是指体系中单电子数的总和;use formal spin as initial是指您可以直接使用默认的体系自旋状态,或者根据体系中电子自旋状态的不同,设置高自旋或者低自旋;或者像反铁磁、顺铁磁等情况。如果您体系中总单电子数为1,initial spin为1。

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  • 我做计算三氧化钼能隙的时候误差很大怎么解决?
    这是在DFT框架内使用LDA、GGA泛函经常出现的问题,可以通过对过渡金属元素加U的方式来解决,另外,也可以选择杂化泛函来进行带隙的计算,也可以得到不错的结果。注意杂化泛函的计算时长相对较长,对服务器的要求也较高。

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  • 我使用castep计算了一个框架化合物的能带,显示为半导体,带隙是1.7eV,可是打开DOS看时发现费米面上也有态密度,请问是怎么回事啊?另外请问可以把我计算的结果图发上去吗?我怕这样说不清楚。谢谢!
    软件在做DOS图时,会有一个展宽,导致价带穿越了费米能级,这一现象不应作为P型掺杂的判据。价带与费米能级的位置关系仅以能带结构计算结果为准。

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  • Discovery Studio中搜索模板采用Blast search (NCBI Server)模块时会报错,什么原因?
    关于BLAST Search (NCBI Server),如遇报错,可尝试如下操作: a登录服务器端 b找到DS安装路径中如下文件: \apps\scitegic\seqanal\lang\perl\BioPerl\Bio\Tools\Run\RemoteBlast.pm 并用txt方式打开,查看$URLBASE是指明什么网址,可以和Blast search (NCBI Server) Protocol中advanced参数保持一致 http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi即可。

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