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  • Discovery Studio中的分子属性可否以表格形式导出?
    DS中直接以表格形式导出数据的话,可以以csv格式导出,如果数据简单的话也可以直接将数据复制粘贴到已经打开的xls文件中。

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  • Discovery Studio中分子指纹有很多类型,该如何选择?
    DS中计算分子指纹时没必要把所有分子指纹参数都选中,可以选择某一种类型即可,DS中分子指纹都是以XXFX_N形式表示,数字N的话即代表迭代次数,一般4或者6即可代表大部分化合物结构,不同字母表示以不同信息来定义分子指纹,具体含义在help文档中也都有说明,一般选择较多类型的是ECFP或者FCFP等;

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  • 请问Discovery Studio 可否计算化合物的fingerprint?
    可通过DS中Calculate molecular property模块来计算获得,在该模块的Molecular properties参数选项选取2D属性中fingerprint下相关分子指纹属性即可。

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  • Discovery Studio中Calculate interaction energy和Calculate binding energy模块在计算受体-配体间能量时有何区别?
    Calculate interaction energy计算的是配体和受体之间的相互作用能,仅考虑两组原子间 的相互作用,计算其间的非键作用能(范德华作用能+静电作用能);Calculate binding energy计算的是配体与受体之间结合自由能,反映受体-配体的结合强弱,与亲和力相关,其最终预测的结合能是根据以下公式计算得到的:Energy (binding) = Energy (Complex) – Energy (Ligand) – Energy (Receptor),因此考虑的因素不仅包含受体-配体间的相互作用,还包含受体和配体本身由于结构构象等因素造成的能量的不同等一些其它因素。不过在计算小分子与部分残基的相互作用,或者以动力学轨迹作为输入文件,来计算每一帧蛋白中两个链之间的相互作用能则只能采用Calculate interaction energy功能。

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  • Discovery Studio中在表明受体-配体相互作用时可作什么类型的图?
    DS可通过2D/3D相互作用图来进行表明受体中关键残基以及关键残基同配体形成的非键作用(包含氢键、疏水、静电等作用),且可对配体所在活性口袋作出表面,用以表明配体在口袋中的整体结合模式,且表面可用不同性质进行着色(如原子电荷性、亲疏水性、溶剂可及性等等)。

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  • 如何选择实验室最佳工具?ELN还是SharePoint? 实验室寻找数字化实验记录本解决方案时,往往纠结于是选择一个真正的电子实验记录本还是像SharePoint这样的方案,不妨先回答以下几个问题再做决定。
    1.实验室只使用Microsoft的产品吗? SharePoint是Microsoft设计、拥有和支持的,所以很多特性只能与Microsoft office产品兼容。这种依赖性限制了一个实验室的其他工具选择,特别是在Web服务器和数据库产品方面。如果实验室只希望使用微软的产品,SharePoint则可能满足他们的需求。如果不愿意被限制其他产品的选择范围,那ELN更合适。 2.是否想确保所有的信息都是可检索的? 实验室纸质记录本给实验人员带来的最大的不便就在于信息检索方面。ELN和SharePoint都可以提供信息检索方面的便利,但是效率大不相同。ELN可以捕获和索引结构化和非结构化的数据,SharePoint不能索引所有的数据信息。如果实验室不需要索引并重复利用实验数据则可以选择SharePoint,反之ELN是最佳选择。 3.有没有法规依从性需求,例如21 CFR Part 11? 联邦药品监管局和美国专利局支持符合21 CFR Part 11法规的产品提交的电子数据。大多数ELN产品是符合21 CFR Part 11的,而SharePoint不符合,所以这一点也可以作为方案选择时重要的考量项目。

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  • Materials Studio7.0发布会我错过了,但是想了解内容,有什么办法吗?
    创腾科技软件的发布会和一些免费资料都可以直接在创腾学院下载。进入方法:百度-创腾学院-学员服务-免费资源中注册下载就以了。或者直接登录下面的链接:http://training.neotrident.com/service/ 注册下载内容。

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