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  • Discovery Studio中可否计算特定pH值下蛋白的偶极矩?
    Discovery Studio4.5中Calculate Protein Ionization and Residue pK模块不仅可以计算蛋白偶极矩随pH值的变化,还可计算静电势对溶剂化和固态状态之间溶剂能差异的贡献值 ΔΔGSolv; 可用于评估蛋白质的溶解性和粘度。

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  • Discovery Studio中可否基于一系列抗体轻链和重链序列批量构建多个抗体Fab区或Fv区的3D模型?
    Discovery Studio4.5新增Antibody Modeling Cascade模块,即可实现该功能,只需输入一组抗体序列,程序即可自动实现模板搜寻、初始模型构建、CDR区重构建等步骤并最终快速构建出单个或多个抗体Fab区或Fv区的三维结构。

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  • 发表文章时如何引用Discovery Studio?
    推荐如下格式:Ref. Dassault Systèmes BIOVIA, Discovery Studio Modeling Environment, Release 4.5, San Diego: Dassault Systèmes, 2015.

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  • Discovery Studio Client 4.5支持64 bit操作系统吗?支持32 bit操作系统?
    DS4.5客户端有32位的版本,也有64位版本。

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  • 近期发布的最新版Discovery Studio4.5都有哪些新功能?
    DS4.5新功能可观看土豆网DS4.5新功能介绍webex视频: http://www.tudou.com/programs/view/O33cm7x1pR0 或网页:http://accelrys.com/products/discovery-studio/

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  • 请问Discovery Studio 4.5对操作系统和硬件的要求?
    DS4.5对操作系统的要求具体可参看链接: http://accelrys.com/products/discovery-studio/requirements/technical-requirements-450.html。

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  • 如果已有小分子和蛋白的结合模式,也有同一小分子和药效团的匹配模式,想要将该药效团匹配到蛋白中,采用DS可否实现?该如何实现?
    采用DS可实现该目的,具体实现方法如下: a.首先确保小分子-蛋白结合模式中小分子是蛋白的一条链而不是一个单独的molecule,然后将蛋白-小分子复合物与药效团-小分子放置于同一个窗口下; b.采用tether的方式将蛋白中小分子匹配于同药效团匹配的小分子上,具体操作方式即选中相应的原子对,每选中一对,点击工具面板中Small molecules/Align small molecules/Add tether ; c.可以多选几对,然后点击Small molecules/Align small molecules/Superimpose by tether即可实现蛋白跟随小分子一起比对到药效团构象处。

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