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  • 2015年11月-药物多靶标预测的多种实现方法

    药物潜在靶标的识别对于早期药物分子的研发、安全性评价和老药新用,以及中草药研究等领域都有着非常重要的意义,但是受制于通量、精度和费用的影响,实验手段的应用难以广泛开展。作为一种快速而低成本的手段,计算机辅助的靶标识别算法的开发正在受到越来越多的重视,发展快速、精确的靶标识别预测方法对于靶向性药物开发、药物-靶标相互作用网络图谱的构建和药物靶向原理都具有十分重要的意义。

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  • 2015年11月-Materials Studio在纳米催化研究中的应用

    研究纳米催化剂的结构与催化活性的关系有着重要的意义。武汉科技大学省部共建耐火材料与冶金国家重点实验室张教授课题组经过多年探索制备了多种纳米颗粒催化剂,并对催化剂的结构-活性的关系进行研究。实验上对纳米团簇的催化根源探索存在困难,因此在对催化剂结构-活性关系的研究中,作者将理论模拟和实验技术相结合,用基于密度泛函方法的Dmol3模块计算了研究了多种纳米团簇的几何/电子结构与催化活性的关联性。本期讲座特邀张教授分享他所带领的课题组在纳米催化研究中的成果及MS软件的使用经验。

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  • 2015年10月-Discovery Studio在先导化合物优化领域的应用

    先导化合物的优化是药物设计领域中重要的研究方向,研究人员通过对先导化合物的研究,添加、修饰一些官能团或取代基,来增加先导化合物的活性。在2013年,分子模拟技术终于修成正果,获得了本年度的诺贝尔化学奖,无疑分子模拟技术将会得到更广泛的应用。

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  • 2015年9月-新型二维半导体的理论设计与实验探索

    近日,南京理工大学纳米光电材料研究所张胜利课题组,在全新二维半导体设计方面取得重要突破,相关成果以 “Atomically Thin Arsenene and Antimonene: Semimetal–Semiconductor and Indirect–Direct Band-Gap Transitions” 为题在线发表在《德国应用化学》上,并被该期刊选为“热点文章(Hot Paper)”、题组设计了具有高稳定性、宽带隙的新型二维单元素半导体—单层砷烯(Arsenene)和锑烯(Antimonene)。一方面,所选取的母体晶体结构是它们最稳定的构型,其层间作用力仅与六方氮化硼接近。另一方面,砷烯和锑烯中每个原子遵循八电子配位,自我调整形成了高稳定的波浪状二维结构,相应的声子谱完全没有虚频。因此,实验上很可能通过机械剥离、液相剥离、气相生长等制备这两类材料。其次,这两类二维材料展现了具有重要应用前景的电子结构转变。砷和锑的层状块材是典型的半金属,而减薄到一个原子厚度后,它们转变成了间接带隙半导体,带隙值分别为2.49和2.28 eV,正好对应于蓝光光谱范围。此外,加载微小的双轴应变,就可实现从间接到直接带隙的转变,以及带隙大小的调控。这些电子结构结果表明,砷烯和锑烯在蓝光探测器、LED、激

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  • 2015年9月-Discovery Studio在先导化合物的发现的应用:虚拟筛选

    随着计算机在药物发现中逐渐发展成为不可缺少的手段,在计算机上利用软件进行药物虚拟筛选已成为先导化合物发现的一种经典且高效的方法。借助计算机进行化合物的虚拟筛选,可以降低实际筛选化合物的数目,同时也可以提高先导化合物的发现效率。具体的虚拟筛选模拟策略有多种:如以靶标结构为基础,通过分子对接技术和片段设计技术,模拟小分子数据库与靶标分子间相互作用,从而虚拟筛选出潜在活性分子;或者以已知同一靶标的活性化合物为基础,通过构建药效团模型并以此作为检索模式来筛选潜在活性化合物;又或者联合不同模拟技术来进行虚拟筛选等等。

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