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DS案例 | 在抗体领域的解决方案——人/鼠PD-1交叉反应抗体的发现和结合机制的研究
计算模拟平台
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DS案例 | 在抗体领域的解决方案——人/鼠PD-1交叉反应抗体的发现和结合机制的研究
解决方案 | 2019-06-28 13:41
实施效果
来源:计算模拟平台

通过Discovery Studio软件预测了人/鼠PD-1交叉反应抗体的结合模式,并辅助以实验验证,从而精细解释了具有人/鼠交叉反应抗体的交叉反应性机制,为后续PD-1抗体研发做出指导。

方案详情

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程序性死亡受体1(PD-1)是一种重要的免疫抑制受体分子,以PD-1为靶点的免疫调节在抗肿瘤、抗感染、抗自身免疫性疾病及器官移植存活等方面均有重要的意义。PD-1抗体是当前备受瞩目,广为关注的一类肿瘤疗法。考虑到PD-1抗体在治疗各种癌症中的重要性和广泛应用,文章作者希望开发同人/鼠PD-1有交叉反应的抗体以加速PD-1抗体的临床前研究。目前批准用于临床或正在研发中的PD-1抗体都只靶向人hPD-1,而并不显示与鼠mPD-1有交叉反应。因此,本文开发并首次报道了一种具有人/鼠PD-1交叉反应的功能性抗体,并将该抗体的表位与仅同hPD-1结合的抗体表位进行了比较。


文章作者首先用hPD-1和mPD-1免疫大鼠,通过筛选大量的大鼠杂交瘤克隆发现了既能靶向hPD-1又能靶向mPD-1的抗体R9和只靶向hPD-1的抗体R11。为了快速识别两个抗体的表位,本研究采用了丙氨酸扫描,并基于ELISA和表面等离子共振技术。同时结合分子模拟的方法,采用Discovery Studio(DS)中MODELER程序构建出了R11和R9抗体结构模型,并在此基础上使用DS_ZDOCK/RDOCK蛋白-蛋白对接/优化程序,将这两个抗体与hPD-1进行了对接,预测了两种抗体不同的结合模式,研究了他们的结合表位,从而精细解释了具有人/鼠交叉反应抗体的交叉反应性机制。


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