1：Discovery Studio 客户端的分子窗口中如何对分子进行选择、旋转、平移及放大缩小等操作？
选择：鼠标左键单击或者按住鼠标左键画圈选择
旋转：按住鼠标右键，上下左右拖动
平移：按住鼠标滑轮，上下左右拖动
缩放：转动鼠标滑轮，向上是放大，向下是缩小。
上述方法是鼠标上的操作，如果是用笔记本上触控板，触控板大多只有两个键，即左键和右键，这时可以将上述功能挨个切换到左键来实现，比如按住触控板左键的同时另一个手指在触控板上滑动也可以实现上述四个功能，切换方式有两种：第一种通过显示出功能图标切换。点击菜单里的View-Toolbars-View,把最后一个View前面的√打上，就会在菜单那一行下方出现几个按钮：
从左到右分别为选择、旋转、平移、缩放等。光标移动到相应按钮，点击触控板上左键，这时触控板左键就是相应功能，按住触控板左键的同时另一个手指在触控板上滑动来实现相应功能。当然这种方式也可以用于鼠标切换即把相应功能切换到鼠标左键上。
第二种是通过右键菜单来切换，在分子窗口中点击鼠标右键或触控板上右键，在显示的快捷菜单中选择相应的功能模式点击鼠标或触控板上的左键，同样也可以将相应功能切换到鼠标左键或者触控板左键上，剩余操作同上。
2：如何在Discovery Studio 客户端分子窗口中以单字母或三字母显示氨基酸名称及序列号？
作图中通常要标记处关键的氨基酸名称和序号，这时可以通过双击要标记的氨基酸中的任意一个原子，这样就选中了该氨基酸，点击鼠标右键菜单中的Lables-Add... 选择Object为AminoAcid, Attribute为Name（单字母或者三字母氨基酸名称设置也在这里设置，如下图），然后设置字体格式、大小和颜色，点击OK即可在窗口中看到该氨基酸的名称，因为该氨基酸被选中，所以显示的颜色为黄色，点击窗口中的空白中，该氨基酸名称即变为绿色。
3：如何对标记出的氨基酸名称进行移动，避免被分子中其它部分遮挡？
作图过程经常遇到标记出的氨基酸名称被分子遮挡的情况，或者旋转分子调整可视化角度之后，氨基酸名称标签就被遮挡，此时需要将氨基酸标签进行移动，重新定位，避免被遮挡。DS客户端默认是不能移动LABEL的，所以需要更改默认设置后才可以移动标签。首先，打开分子表单窗口（Ctrl+T），点击表单窗口下方的Label标签，将Movable那一列下面的方框勾上，这样就可以移动标记出的氨基酸名称了。然后在分子的可视化窗口中鼠标左键选中显示的氨基酸名称（如下图中的LYS55），选中之后，该名称会变成黄色。然后按住Ctrl+鼠标滑轮，拖动鼠标，就可以移动该氨基酸名称了。
4. 如何显示分子中两个原子之间的距离、三个原子的角度或四个原子的二面角？
首先根据我们显示的目的，先在分子窗口中通过SHIFT+左键选中分子中的两个（三个或四个）原子，然后点击菜单
Structure-Monitor-Distance显示距离，当然如果选三个原子是显示角度，四个原子是显示二面角，分别对应Angle和Torsion。
