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Q&A | 2020年9月Discovery Studio Q&A精选
计算模拟平台
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Q&A | 2020年9月Discovery Studio Q&A精选
9月精选
解决方案 | 2020-09-02 10:39
2020年9月Discovery Studio 技术干货Q&A专题
来源:计算机模拟平台

每月初,创腾科技生命科学模拟技术部都会通过微信公众号定期总结 Discovery Studio 用户在软件使用过程中产生的一些具有代表性的问题。基于我们的工程师团队在分子模拟领域内十多年的经验,定期为大家带来实实在在的技术干货分享。

技术干货Q&A分享

1. 在运用LibDock做虚筛时,假如选择了100个不同的配体进行对接,设置每个配体保留前10个构象,这样最终就可能会有1000个对接结果,但是不想对每个结果都进行查看,只想看每个配体打分最高的结果应该如何做呢?

答:可以在表格窗口中鼠标右键点击Filter,选择LibDockScore,将Choice设置为Top(#),Value设置为1,Group By选择Name点击OK就可以了。


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2. 化合物经过Lipinski’s五原则过滤后,为什么结果中会存在分子量大于500的化合物呢?

答:DS中Number of Violation Allowed默认设置时1,意思就是当某个化合物违背五原则的个数小于或等于1时是可以被留下的。这个时候可以将Number of Violation Allowed设置为0。


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3. 活性位点定义好,想修改球体半径,应该怎么做?

答:先选中球体,然后鼠标右键点击Attributes of SBD_Site_Sphere”,再将窗口中的Radius数值根据所需修改即可。


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4. windows系统下如何重启服务器?

答:服务器装在本机一般是重启电脑,但是有的电脑设置时手动重启,所以先点击计算机图标——右键——管理——服务和应用程序——服务(选择BIOVIA Pipeline Pilot X右键属性),将手动改成自动即可。


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5. DS储存结果的默认盘内存不足,这是应该怎么更改默认路径。

答:先点击Edit选择Preferences再选择Files Explorer就可以看到Select path for default folder。


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6. 提交任务计算时总是报错、计算结果打不开是什么原因呢?

答:提交任务计算时总是报错、计算结果打不开等一系列莫名错误出现时,请检查电脑用户名、DS安装路径、输入文件存放路径中是否存在中文以及一些特殊符号,如有请修改后再次运算和查看结果。