BIOVIA Discovery Studio Q&A精选-创腾科技

2020年10月 BIOVIA Discovery Studio 技术干货Q&A专题

来源：计算机模拟平台

每月初，创腾科技生命科学模拟技术部都会通过微信公众号定期总结 BIOVIA Discovery Studio 用户在软件使用过程中产生的一些具有代表性的问题。基于我们的工程师团队在分子模拟领域内十多年的经验，定期为大家带来实实在在的技术干货分享。

本月的技术干货Q&A分享我们将给大家带来在DS中使用正则表达式选择蛋白中的氨基酸的小技巧，可以极大的方便我们来有目的批量选择氨基酸。

如何从蛋白结构中一次选取氨基酸序列号在100之前的THR和TYR氨基酸？

菜单-Edit-Select ...打开菜单，如下图设置，选择正则表达式：T.R..

根据正则表达式的规则，点可以代表一个字符，比如字母或数字，因此，T.R..中前三个字符代表氨基酸名中第一个字母是T，第二个字母不定，第三个字母为R的氨基酸，这样就只有THR和TYR，R后面点的个数代表了数字的位数，如果是100号之前，则R之后只有两个数字，所以是两个点，点击Apply后可以看到，蛋白中序号为两位数的TYR和THR被选中了。依次类推，如果选择序号为个位数的，可以使用T.R.来匹配，当然前提是蛋白结构中10号之前得有相应氨基酸，否则是选不上的。部分正则匹配规则如下：

同样，如果寻找序列号在10-19之间的T.R类氨基酸可以使用T.R1.来匹配查找，具体其它正则表达式大家有兴趣可以自己探索一下。