本次讲座将基于新型冠状病毒2019-nCoV中一个蛋白酶的一级序列使用Discovery Studio 2020中的MODELER进行3D结构预测，包括序列比对、搜索模板、构建模型、优化模型等。
在分子模拟中，蛋白质的三维结构信息对于研究蛋白质的功能及作用机制具有重要意义,但有些蛋白质的结晶难以获得,或者获得的晶体结构中研究的关键区域有较多氨基酸缺失，导致结构不完整等，这种情况下是无法使用后续的分子对接等分子模拟手段对蛋白进行深入研究的。而同源模建很好的解决这一问题，是分子模拟中的一种重要手段。同源模建的基本假设是序列的同源性决定了三维结构的同源性，一个未知结构的蛋白质分子(目标蛋白)的结构是可以通过与之序列同源且结构已知的蛋白质(模板蛋白)来进行预测的。与目标蛋白序列同源性大于30%、且已发表晶体结构的蛋白作为模板，利用同源模建技术构建目的蛋白三维结构,从而可以分析蛋白的活性口袋、特异性氨基酸与抑制机理等结构信息。
Discovery Studio（简称DS），是基于 Pipeline Pilot构建的面向生命科学领域的综合分子模拟平台。交互式强，易于使用的视窗操作界面和经过多年验证的科学算法和集成环境使得DS被广泛的用于生命科学的各个研究领域如实验生物学、药物化学、结构生物学、计算生物学和计算化学等。DS中包含了在同源模建领域的经典算法程序MODELER，基于该程序，在DS中可以非常方便的基于一段未知结构的序列，进行序列比对、搜索模板、构建模型、优化模型等。
注: 本次网络培训属于2020年生命科学模拟技术系列讲座，我们会陆续推出后续的讲座，最新讲座安排请关注我们的网站或联系我们索取相关资料。
