讲座主题:Perl语言脚本在Materials Studio中的应用
讲座时间:2020年9月25日(周五),14:00
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我们熟知的Materials Visualizer已经为用户提供了功能丰富且便于操作的可视化界面,使用户能很快上手管理计算文档、搭建模型、可视化分析处理计算结果。但是,很多时候我们仍需要遵循Materials Studio给定的已有逻辑框架去进行计算模拟分析。而无法自由自在地按照我们的思路和意愿去模拟和分析一些特定的过程。
而Perl脚本正是Materials Studio为中高阶用户提供的一个Plan B。这是一个能够帮助我们来更灵活调用计算引擎来实现我们目的的工具。
以下为几个典型的脚本应用场景:
→ 自动化重复提交计算任务
→ 复杂模型的搭建
→ 模块面板功能的拓展
→ 数据的分析统计
本次讲座主要以Perl语言脚本在分子模拟中的应用为主题,为大家介绍如何在Materials Studio 中使用“性感而自由”的Perl语言脚本,其中所涉及到的模块主要是Forcite Plus。脚本的学习和使用能让我们在分子模拟的过程中更加的自由洒脱。
讲座的主题如下:
→ 脚本的创建、修改、检查与运行等基本操作与注意事项;
→ 模型中官能团的修饰;
→ 统计环状模型体系中分子的数目;
→ 轨迹文件中氢键的统计;
→ 体系能量组分的提取;
→ 批量化提交计算任务;
→ 海水淡化膜过滤盐离子过程模拟与数据分析;
→ Perl语言学习资源。
Perl语言脚本可以实现的的功能很多,让我们先直观地感受一下Perl脚本能够帮助我们完成哪些sexy的事情吧!
活性炭模型
石墨烯的拔出
纳米复合材料的拉伸
石墨烯的剥离
海水淡化膜的过滤过程
过滤过程中粒子穿过膜的数量统计