Phoenix NLME 是一个PK/PD建模软件,用户友好,易于学习。Phoenix NLME是在Phoenix工作平台体系结构的基础上构建的,图形化的操作界面使用户能够专注于建模,而不是专注于实现建模所需的工具或代码。这样就有更多的时间进行分析和战略决策。Phoenix NLME 是当今科学家可用的、最强大的非线性混合效应建模平台之一,被1400名科学家、全球前20家制药公司中的18家、著名学术机构和包括美国食品和药物管理局(FDA)在内的多个监管机构在使用。此外,Phoenix NLME 是第一个支持开箱即用,并且支持在计算机群组阵列上进行远程并行化运算的PK/PD建模软件(需要Certara支持)。
用户友好的PK/PD建模软件
Phoenix NLME 使用了一个现代的、直观的图形用户界面(GUI),它实现了建模想法和实践之间无缝转换。
l 完整的内置模型库,或使用图形化模型编辑进行快速自定义建模。无论哪种情况,都可以转化为Phoenix Modeling Language (PML)来获得完整的模型代码,这是一种易于阅读和理解的现代建模语言。
l Phoenix NLME 完成每次模型计算后自动生成所需的诊断表(参数结果表)和图形(GOF, 残差分布图等),支持对模型结果的即时评估,以便快速、轻松地识别和纠正模型中的错误。
l 提供多种协变量筛选模式,通过运行选项下的逐步法、鸟枪法以及自定义场景寻找协变量可帮助用户自动、快捷地筛选协变量
l 提供内置的模型验证脚本,无须借助其他工具来完成,包含VPC和Bootstrap
以上这些特性结合Phoenix平台内建的数据工具、统计工具和作图工具,使得Phoenix NLME 成为目前最好用的群体PK/PD建模和仿真平台之一。
功能强大,广泛用于群体PK/PD建模和仿真
Phoenix NLME 是为获得最佳性能和最大灵活性而开发的。无论是初学者还是高级用户都可以利用NLME的强大功能进行PK/PD分析。Phoenix NLME包括一整套非线性混合效应模型的算法,包括QRPEM,最先进的期望最大化算法之一。在测试中发现QRPEM始终是EM类方法中收敛速度最快的,这说明了它的优势。参数估计、模拟、自动协变量寻找、bootstrap参数估计以及VPC视觉检验,这些功能的整合给用户提供了进行完整的Pop PK/PD分析提供了极大的便利。
指导模型建立
Phoenix NLME 提供了最佳建模策略的开发与执行分析所需的相应工具之间的完整的1到1映射。通常,PK/PD建模最困难的部分是为研究建立正确的模型。Phoenix NLME通过药物模型探索(Drug model Explorer, DME)的图形模型构建界面简化了这一过程。该界面可以轻松创建自定义模型,包括多个吸收或清除途径模型、原药代谢物模型和暴露-反应模型等。DME还可以自动生成PML代码,帮助用户了解学习PML代码编写。将软件的这些创新特性与Certara University的课堂/在线培训课程相结合,使得Phoenix NLME 对于初学者来说很容易学习,对于建模新手来说很容易上手,对于高级用户来说很容易深入学习。
Phoenix NLME包含的算法
VPC视觉预测检验
视觉预测检验(VPC)是对观测值和模拟预测的图形比较和分析。Phoenix NLME 中VPC为用户提供了更广泛的适用性和灵活性。包括对不同数据类型,如连续数据(低于定量下限数据(BQL)),以及对离散数据(分类变量、单个事件时间和计数数据)进行单独分析。另外支持对不同的分类变量单独进行视觉检验。
高效的计算性能
Phoenix NLME 能够以两种不同的方式实现并行计算,以优化计算集群和多核计算机性能的发挥。
第一种被称为通过模型并行化(PBM),在这种并行化中,单个的NLME模型被发送到不同的计算核心执行。比如Bootstrap进行200个循环,它需要运行200个独立的NLME模型。使用PBM,将把200个模型中的每个发送到200个独立的计算节点,每个模型在单个计算节点上运行。PBM对于同时执行多个NLME模型非常有用。
第二种方法被称为模型内并行化(PWM),其中一个单独的NLME模型被分散在多个计算核上执行。PWM的一个例子是一个PK/PD模型的简单估计。使用PWM,一个模型将分布在50个计算核上,允许比使用本地计算机更快地运算成功。PWM对于单个模型计算量大,很难收敛的复杂模型具有很好的适用性。
Phoenix NLME同时支持PBM和PWM,甚至支持两者的组合。在逐步协变量筛选中可以看到PBM和PWM相结合的例子。第一步,让我们假设有8个模型要运行(基础模型+ 7个可能的协变量模型)。Phoenix将同时运行所有8个模型(PBM),每个模型使用20个计算核心(PWM)。结合PBM和PWM可以非常强大地减少复杂PK/PD模型的总体运行时间。
区别于其他Pop PK/PD建模分析软件,以上并行化运行只需要有Phoenix NLME 授权即可,无须以核心数量单独收费。
互通性
Phoenix NLME可以与任何PK/PD软件进行相互转化(代码或者图形),Phoenix还提供了与SAS®、R®、SigmaPlot®、NONMEM®、PSN、Watson LIMS®等软件的连接,可实现数据的共享。这允许用户将以上第三方的软件工具集成到Phoenix工作流中,以确保一致性和数据可追踪性。Phoenix NLME 导出结果至PK/PD的分析报告极为方便,任何图形、图片或表格都可以通过方便的导出到Microsoft® Word文档中。此外,通过Phoenix Reporter工具,用户可以将一系列图表、图表和表格编译成一个Microsoft® Word文件,其中包含定制的编号和标题。随后可将次输出的报告作为PK/PD分析报告的附件,以便在内部汇报和进行监管提交。
充分利用您使用Phoenix WinNonlin的经验
Phoenix NLME 基于Phoenix平台构建的,和WinNonlin具有相同的GUI操作特性和习惯。并且可以结合WinNonlin建立一个全面的PK/PD建模和仿真平台,应用于药物研发的所有阶段,包括监管提交。数据处理、PK/PD建模、后期统计分析、表格创建和集成图形引擎的集成工具为科学家、审阅人员、医学作家和质量保证团队成员创建了一个一体化的协作工作平台。
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「Intercept制药公司」一家新兴的全球生物制药公司,需要开发一种奥贝胆酸(OCA)的给药策略,用于治疗原发性胆道胆管炎(PBC)患者。Certara科学家使用Phoenix NLME建立了一个生理PK模型来定义有或无肝损害的PBC患者OCA全身和肝脏暴露之间的关系。建模结果证实了OCA给药方案对PBC患者的安全性和有效性。
案例二: NLME & Trial Simulator: M&S优化药物III期试验设计来帮助获得FDA批准(1)
建模和模拟(M&S)正在改变药物开发以及药物如何接受监管审查的方式。Certara公司旗下的Phoenix NLME和Trial Simulator等定量药理学相关软件利用动物试验和临床试验现有数据建模,通过模拟减少不确定性,提高药物研发效率和生产力,并为赞助公司的药物研发做出更具成本效益的决策。
案例三: Phoenix NLME & Trial Simulator设计III期试验来帮助获得FDA批准 (2)
M&S在药物开发和监管申报中扮演着越来越重要的角色。在本案例中,Phoenix NLME和Trial Simulator扮演了重要角色,通过模拟评估了III期试验复杂的适应性设计,并在其中选择一种符合FDA要求并最有可能成功的设计。经过优化的研究设计使文中的口服睾酮产品获得批准,目前已将该药物投放市场。